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华大 | 单细胞 RNA 测序

技术简介

DNBelab C 系列高通量单细胞 RNA 文库制备试剂盒套装 V3.0 在原版本基础上完成了全新升级,包括液滴生成仪器 TaiM4,加样载片,液滴生成试剂,高通量文库制备试剂和开源的数据质控分析包来支持全流程的单细胞测序分析。

DNBelab C 系列高通量单细胞 RNA 文库制备

技术原理

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双磁珠捕获系统:mRNA 捕获磁珠与液滴识别微珠,提高捕获效率。

DNBelab C4 平台是基于微流控技术原理,通过双磁珠系统(大磁珠捕获 mRNA,小磁珠识别大磁珠)精准识别磁珠多胞、增加捕获效率。大磁珠捕获 mRNA 和小磁珠释放的 Oligo 之后的结构如图所示,之后 cDNA 的 Oligo 会分开建库测序,Cell barcode 和 Oligo index 建立 reads- 磁珠 - 细胞的映射关系。

仪器平台

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DNBelab C-TaiM 4 单细胞液滴生成仪;

DNBelab C-TaiM 4 单细胞液滴生成仪,配备 4 个独立控制的微流控通路,同时兼容单细胞 3'RNA 文库和 ATAC 文库制备,支持 1~4 样本灵活上样,小巧轻便、即开即用,适用于 2.5 千米以下海拔的实验室环境。


伯豪优势


1、平台互补:与 10X Genomics 等平台的互补,客户灵活自选。

2、覆盖度高:测序覆盖 cDNA 的全长序列,每个细胞能够获得上万个基因的表达。

3、信息个性化:除了获得基因表达信息,数据能够用于可变剪接,cSNP 等分析,以及带 poly- A 结构的 lncRNA 研究。

样本要求

DNBelab C 系列高通量单细胞 RNA 文库制备试剂盒开展的研究或应用涵盖的样本类型丰富,包括人、鼠等 动物和拟南芥、水稻等植物超过 50 个物种的 300 多个组织类型。

 k8凯发生物华大设备单细胞测序适用样本类型


技术参数


DNBelab C 系列高通量单细胞 RNA 测序

根据实验经验表明,人的 PBMC 细胞、脑细胞核、脂肪细胞核、鼠肺癌细胞等样本类型的细胞捕获效率 >50%,基因检出均达到 1000 多。


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此外,实验经验证实,DNBelab C 系列高通量单细胞 RNA 文库制备试剂盒套装性能非常稳定,平行样本实 验结果具有很高的一致性。

图 4


案例展示

DNBelab C 系列高通量单细胞 RNA 测序已广泛应用于科学研究和临床应用,尤其是在肿瘤、微生物、神经科学、免疫学等领域均有高分文章发表。

  肿瘤 微生物   神经科学   免疫学    其它

案例展示

  截止 2024 年 5 月,利用 DNBelab C 系列高通量单细胞 RNA 测序技术进行研究发表的文章累计 80 多篇,尤其是在 Nature,Cell,Cell Research,Immunity 等国际顶刊也发表过多篇代表性文章。


文献案例 1:猕猴全身器官细胞图谱

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文章标题:Cell transcriptomic atlas of the non-human primate Macaca fascicularis

发表期刊:Nature 

影响因子:64.8 

发表时间:2022.04 

样本信息: 猕猴全身 45 种器官或组织  

研究摘要: 利用 DNBelab-C4 和 DNBSEO 测序平台,对食蟹猴的主要组织器官(肺、肾脏、肝、胰腺、大脑、主动脉、甲状腺、腮腺和血液)进行单细胞转录组测序,建立了食蟹猴单细胞转录组数据库,鉴定出 44 种 食蟹猴的主要细胞类型,在国际上首次完成构建非人灵长类单细胞图 V1.0,对于新冠药物和疫苗的研发具有重要指导作用。


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文献案例 2:体外诱导获得人类全能干细胞

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文章标题:Rolling back human pluripotent stem cells to an eight-cell embryo-like stage 

发表期刊:Nature 

影响因子:64.8 

发表时间:2022.03 

样本信息: 人类 8C 期胚胎样细胞(8CLC) 

研究摘要: 该研究利用 DNBelab-C4 和 DNBSEQ 测序平台,对 8CLC 诱导过程的细胞样本进行了单细胞 转录组(scRNA-seq)和染色质可及性(scATAC-seq)测序,详细分析了 8CLC 群体的特征,并在多个诱导 时间点描绘了 8CLC 诱导过过程中转录组和染色质开放性的动态变化,为研究人类 8 细胞期的合子基因 组激活和发育调控提供了重要的平台和资源。

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文献案例 3:最详尽的人类骨骼肌衰老大细胞图谱

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文章标题:Multimodal cell atlas of the ageing human skeletal muscle 

发表期刊:Nature 

影响因子:64.8 

发表时间:2024.05 

样本信息: 来着不同性别,不同年龄的 31 个人下肢肌肉骨骼肌 研究摘要:该研究利用单细胞核转录组、单细胞核染色质开放组技术,结合组织染色,构建了包含 31 个 人(包括 17 名男性和 14 名女性,覆盖 15-99 岁的人群)下肢肌肉骨骼肌多模态单细胞图谱。通过对 387000 多个细胞 / 核的深入分析,研究人员详细描述了细胞群体在衰老过程中的变化,包括老年人群 新出现的细胞群体,以及这些变化背后的细胞特异性特征和多细胞间的网络互动特性。该研究在转录 组学和表观遗传学层面上深入探讨了与骨骼肌衰老相关的分子机制。

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