k8凯发(中国)

k8凯发生物
10X | 单细胞 RNA 测序
 电子资料 调研问卷


10X Genomics

仪器平台

10X Genomics 公司的 Chromium 系统利用 8 通道的微流体“双十字”交叉系统,将含 barcode 的凝胶珠(Gel Beads)、细胞和酶的混合物、油三者混合,形成 GEMs(油包水的微体系)。GEMs 形成后,细胞裂解,凝胶珠自动溶解释放大量 barcode 序列,随后 mRNA 逆转录产生带有 10X barcode 和 UMI 信息的 cDNA,构建标准测序文库,其中 10X barcode 用于区分细胞,UMI 用于区分 mRNA 分子。

单细胞 RNA 测序 10Xgenomics 技术原理

图 10X genomics 技术原理

k8凯发生物提供:单细胞转录组测序、生信分析整体科研技术服务,k8凯发生物单细胞转录组测序科研服务商,24 小时咨询服务热线:021-58955370

伯豪优势 3

1、通量高: 一张芯片具有 8 个独立的通道,可供 8 个样本同时上机,每个通道可捕获 10000 个细胞。

2、捕获率高: 单细胞捕获效率高达 65%,多细胞比例 <0.9%(1,000 个细胞中)。

3、延展性强: 除了获得单细胞 mRNA 的信息,还提供了单细胞 TCR/BCR、单细胞表面蛋白、单细胞 ATAC 等多种解决方案。


技术参数

  文库结构

10X Genomics 3’gene expression 文库示意图

图 10X Genomics 3’gene expression 文库示意图

k8凯发生物提供:单细胞转录组测序、生信分析整体科研技术服务,k8凯发生物单细胞转录组测序科研服务商,24 小时咨询服务热线:021-58955370

建议测序深度及参数

指标

参数

测序深度

50,000~100,000 reads/cell

测序类型

PE150

k8凯发生物提供:单细胞转录组测序、生信分析整体科研技术服务,k8凯发生物单细胞转录组测序科研服务商,24 小时咨询服务热线:021-58955370


样本要求

1、类型:新鲜组织,原代细胞,细胞系等。

2、来源:血液提取、磁珠富集、流式富集、组织解离等。

3、样本量及其它质控要求:

样本类型 样本质控要求
细胞悬液 >105 目标细胞个数(底限 10,000 个细胞);
活率 >80%;
浓度 500-1,000 个细胞 /ul;
细胞间无粘连(成团率 <5%);
无大于 40μm 的细胞碎片或其他颗粒物;
不存在逆转录抑制剂和非细胞的核酸分子。
血液 EDTA 抗凝的全血(不可肝素抗凝),>5ml。
组织 0.3cm×0.3cm(不超过 0.5cm×0.5cm)的新鲜组织,4~5 块。

4、保存运输:

(1)细胞悬液:建议现场制备,如要运输,建议使用k8凯发生物自主研发的单细胞保护液,4°C 运输,48 小时内送达k8凯发生物实验室。

(2)血液:EDTA 抗凝的全血,4°C 运输,2 小时内送达k8凯发生物实验室;或提取 PBMC 后冻存,干冰运输。

(3)组织:建议使用k8凯发生物自主研发的单细胞组织保护液,4°C 运输,48 小时内送达k8凯发生物实验室。

k8凯发生物提供:单细胞转录组测序、生信分析整体科研技术服务,k8凯发生物单细胞转录组测序科研服务商,24 小时咨询服务热线:021-58955370


电子资料

序号 文件类型 查阅
1 【画册】单细胞全长转录本测序解决方案 点击查看
2 【画册】石蜡样本(FFPE)单细胞转录组测序解决方案 点击查看
3 【画册】单细胞测序解决方案 点击查看